DeepMind AI с голям напредък в разкодирането на протеиновата структура

На 30-ти ноември тази година се проведе ежегодното мероприятие (този път виртуално), на което се дискутират резултатите от отправеното предизвикателство CASP (Critical Assessment of Structure Prediction) за предсказване на структурата на белтъците спрямо аминокиселините, които ги съставят. От него стана ясно, че изкуственият интелект DeepMind на Гугъл се е справил най-добре благодарение на своята програма AlphaFold.

 

Според Джон Моулт, биолог от университета в Мериленд, Колидж Парк, който е още и съосновател на проекта, това е огромна крачка и напредък в сферата. Той стига и по-далеч, заявявайки, че “проблемът в известна степен е решен”.

 

Разкриването на структурата на белтъците не само показва каква роля играят те, но и ще ни позволи да разберем повече неща за съставните части на клетките, както и ще тласне разработката на нови медикаменти напред. Друг голям плюс е, че точността в предсказанията не се отдалечава от тази на “златния стандарт” – рентгеновата кристалография – при това на много по-ниска цена.

 

Предсказването на структурата на даден белтък е от съществено значение, за да знаем как работи той и какво прави. Интересното е, че той добива съответната форма без напътствия, а само под въздействието на физичните закони.

 

Въпреки че подобрението в резултатите от предизвикателството тази година се дължат главно на AlphaFold, то около половината от участниците споменават, че са използвали изкуствен интелект като deep learning (невронни мрежи) в техните разработки. Това показва важността му в опитите за прогрес.

 

AlphaFold вече помогна за разгадаването на структурата бактериален протеин, която от години беше загадка. Авторите на алгоритъма казват, че тепърва ще се опитват да направят тяхната програма по-достъпна спрямо нуждите на биолозите. На изкуствения интелект му отнема няколко дни да излезе с краен резултат за даден белтък, но влиянието, което може да окаже в сферата, си остава потенциално огромно.

 

Според учените е рано да говорим, че лабораториите, експериментиращи с протеини, ще затворят, но в едно са убедени – това е едно от най-значимите реални приложения на изкуствен интелект в наши дни. 

 

Източник:
https://www.nature.com/articles/d41586-020-03348-4

Иван Григоров

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *